"Нехорошесть" квартиры может быть вызвана вполне физческими причинами. В принципе любыми воздействиями, которые расшатывают психику.

Например - какие нибудь примеси в воздухе. Примеси в водопроводной воде (скажем в трубах проблемы). Электромагнитные поля. (у соседа по квартире - радар дома установлен :-) )
Повышенный радиоактивный фон у стен (завист от материалов из которых строили стены). Да мало ли какая беда может быть?